Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCG2P13521 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCG2P13521 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCG2P13521 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCG2P13521 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCG2P13521 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCG2P13521 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG2P13521 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG2P13521 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG2P13521 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG2P13521 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG2P13521 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG2P13521 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG2P13521 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG2P13521 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG2P13521 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG2P13521 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCG2P13521 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCG2P13521 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCG2P13521 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG2P13521 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG2P13521 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG2P13521 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG2P13521 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG2P13521 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG2P13521 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG2P13521 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCG2P13521 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCG2P13521 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCG2P13521 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCG2P13521 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms