Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GP1BBP13224 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms