Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL6A2P12110 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL6A2P12110 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms