Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCF2P10911 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCF2P10911 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCF2P10911 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MCF2P10911 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCF2P10911 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCF2P10911 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCF2P10911 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MCF2P10911 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2P10911 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2P10911 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCF2P10911 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms