Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARBP10826 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARBP10826 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARBP10826 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RARBP10826 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARBP10826 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARBP10826 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARBP10826 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms