Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf88P0DMB2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms