Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRGAP2CP0DJJ0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms