Protein–RNA interactions for Protein: P0CX28

RPL42B, 60S ribosomal protein L42-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL42BP0CX28 VPS3YDR495C 3036 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YDL068WYDL068W 330 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 USE1YGL098W 738 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 RPS21BYJL136C 264 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 ABM1YJR108W 372 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 MRP8YKL142W 660 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 TFB1YDR311W 1929 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 NUP60YAR002W 1620 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 GLC3YEL011W 2115 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YJR098CYJR098C 1971 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 SLA1YBL007C 3735 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 XRN1YGL173C 4587 nt2.63□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 FAS1YKL182W 6156 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 KAP95YLR347C 2586 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 TSA2YDR453C 591 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 RPS23AYGR118W 438 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YIR040CYIR040C 333 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YKL111CYKL111C 336 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YKL118WYKL118W 312 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 URA10YMR271C 684 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 GIS2YNL255C 462 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YOR146WYOR146W 306 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YPL276WYPL276W 438 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 TIM12YBR091C 330 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YAK1YJL141C 2424 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 NDT80YHR124W 1884 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 BUD4YJR092W 4344 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 POL2YNL262W 6669 nt2.62□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.61□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YSW1YBR148W 1830 nt2.61□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 PKH1YDR490C 2301 nt2.61□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 MAM33YIL070C 801 nt2.61□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.61□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 RPS7BYNL096C 573 nt2.61□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 RPS7AYOR096W 573 nt2.61□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 RAD5YLR032W 3510 nt2.61□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 ETP1YHL010C 1758 nt2.61□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 STU2YLR045C 2667 nt2.61□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 SIZ1YDR409W 2715 nt2.61□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 PDC2YDR081C 2778 nt2.6□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YDL071CYDL071C 375 nt2.6□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.6□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 COX23YHR116W 456 nt2.6□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 RPC10YHR143W-A 213 nt2.6□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 PET191YJR034W 327 nt2.6□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 MRPL31YKL138C 396 nt2.6□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 RFC3YNL290W 1023 nt2.6□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 NSL1YPL233W 651 nt2.6□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 SWD3YBR175W 948 nt2.6□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YEL025CYEL025C 3567 nt2.6□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 RPN2YIL075C 2838 nt2.6□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 SPC72YAL047C 1869 nt2.59□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YJR003CYJR003C 1560 nt2.59□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 APC11YDL008W 498 nt2.59□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 STE14YDR410C 720 nt2.59□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 TWF1YGR080W 999 nt2.59□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 DLS1YJL065C 504 nt2.59□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.59□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 VTI1YMR197C 654 nt2.59□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 snR191snR191 274 nt2.59□□□□□ -1.99
RPL42BP0CX28 MIT1YEL007W 2001 nt2.59□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 GCD10YNL062C 1437 nt2.59□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 SQS1YNL224C 2304 nt2.58□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 ZDS2YML109W 2829 nt2.58□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YDL180WYDL180W 1644 nt2.58□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 NOP4YPL043W 2058 nt2.58□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.58□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.58□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.58□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 SGN1YIR001C 753 nt2.58□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 PFK26YIL107C 2484 nt2.58□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 SIP3YNL257C 3690 nt2.57□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 MRH1YDR033W 963 nt2.57□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 SDC1YDR469W 528 nt2.57□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 IES6YEL044W 501 nt2.57□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.57□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YHL037CYHL037C 402 nt2.57□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YKL083WYKL083W 615 nt2.57□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 RPA135YPR010C 3612 nt2.56□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 COP1YDL145C 3606 nt2.56□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YDL152WYDL152W 366 nt2.56□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.56□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YPR014CYPR014C 330 nt2.56□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YHR080CYHR080C 4038 nt2.56□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 DNM1YLL001W 2274 nt2.56□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 NPR1YNL183C 2373 nt2.56□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 RAD2YGR258C 3096 nt2.55□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 SET1YHR119W 3243 nt2.55□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YCR022CYCR022C 345 nt2.55□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 AAD3YCR107W 1092 nt2.55□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 SNX41YDR425W 1878 nt2.55□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 CDH1YGL003C 1701 nt2.55□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 YIL054WYIL054W 318 nt2.55□□□□□ -2
RPL42BP0CX28 MDV1YJL112W 2145 nt2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.8 ms