Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM200BP0CF97 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms