Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PKHD1P08F94 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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