Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP3P08254 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP3P08254 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP3P08254 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP3P08254 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP3P08254 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP3P08254 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP3P08254 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP3P08254 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP3P08254 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP3P08254 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP3P08254 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP3P08254 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP3P08254 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP3P08254 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP3P08254 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP3P08254 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP3P08254 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP3P08254 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP3P08254 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP3P08254 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP3P08254 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP3P08254 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP3P08254 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms