Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NGFRP08138 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NGFRP08138 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NGFRP08138 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms