Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPM2P07951 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPM2P07951 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPM2P07951 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPM2P07951 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms