Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL2A1P02458 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms