Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HLA-HP01893 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms