Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LTAP01374 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LTAP01374 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LTAP01374 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTAP01374 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTAP01374 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTAP01374 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTAP01374 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTAP01374 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTAP01374 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LTAP01374 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTAP01374 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTAP01374 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTAP01374 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTAP01374 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTAP01374 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTAP01374 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTAP01374 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTAP01374 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms