Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM13AO94988 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM13AO94988 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms