Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UFL1O94874 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UFL1O94874 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UFL1O94874 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UFL1O94874 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UFL1O94874 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UFL1O94874 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UFL1O94874 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UFL1O94874 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UFL1O94874 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UFL1O94874 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UFL1O94874 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UFL1O94874 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UFL1O94874 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UFL1O94874 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UFL1O94874 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UFL1O94874 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UFL1O94874 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms