Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LTN1O94822 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LTN1O94822 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTN1O94822 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTN1O94822 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LTN1O94822 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LTN1O94822 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LTN1O94822 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTN1O94822 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTN1O94822 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LTN1O94822 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LTN1O94822 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LTN1O94822 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LTN1O94822 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTN1O94822 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LTN1O94822 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LTN1O94822 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTN1O94822 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTN1O94822 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTN1O94822 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTN1O94822 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTN1O94822 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTN1O94822 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LTN1O94822 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTN1O94822 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTN1O94822 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTN1O94822 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTN1O94822 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTN1O94822 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTN1O94822 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTN1O94822 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTN1O94822 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTN1O94822 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTN1O94822 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTN1O94822 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LTN1O94822 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms