Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OFD1O75665 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OFD1O75665 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OFD1O75665 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OFD1O75665 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OFD1O75665 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OFD1O75665 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OFD1O75665 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OFD1O75665 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OFD1O75665 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OFD1O75665 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OFD1O75665 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OFD1O75665 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OFD1O75665 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OFD1O75665 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OFD1O75665 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OFD1O75665 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OFD1O75665 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OFD1O75665 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OFD1O75665 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OFD1O75665 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OFD1O75665 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OFD1O75665 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OFD1O75665 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OFD1O75665 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OFD1O75665 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OFD1O75665 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OFD1O75665 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OFD1O75665 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
OFD1O75665 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OFD1O75665 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OFD1O75665 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OFD1O75665 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OFD1O75665 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OFD1O75665 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms