Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSDE1O75534 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSDE1O75534 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms