Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM4AO75164 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM4AO75164 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms