Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TIMM17BO60830 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms