Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAK2O60296 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms