Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms