Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB2O43741 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB2O43741 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms