Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms