Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA2O43364 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms