Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYNMO15061 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SYNMO15061 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYNMO15061 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYNMO15061 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYNMO15061 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNMO15061 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNMO15061 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNMO15061 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNMO15061 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNMO15061 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNMO15061 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNMO15061 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNMO15061 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNMO15061 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNMO15061 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNMO15061 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNMO15061 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNMO15061 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNMO15061 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNMO15061 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNMO15061 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNMO15061 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNMO15061 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNMO15061 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNMO15061 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNMO15061 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNMO15061 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNMO15061 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNMO15061 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNMO15061 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNMO15061 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNMO15061 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNMO15061 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNMO15061 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNMO15061 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNMO15061 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNMO15061 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNMO15061 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNMO15061 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNMO15061 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNMO15061 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNMO15061 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNMO15061 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNMO15061 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNMO15061 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNMO15061 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SYNMO15061 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SYNMO15061 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SYNMO15061 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SYNMO15061 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SYNMO15061 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNMO15061 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNMO15061 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms