Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EBAG9O00559 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EBAG9O00559 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms