Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CDO00329 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms