Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIP1O00291 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIP1O00291 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIP1O00291 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIP1O00291 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIP1O00291 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIP1O00291 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIP1O00291 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIP1O00291 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIP1O00291 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIP1O00291 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIP1O00291 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIP1O00291 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIP1O00291 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIP1O00291 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIP1O00291 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIP1O00291 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms