Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNAP23O00161 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAP23O00161 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms