Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QKU1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QKU1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QKU1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QKU1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QKU1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QKU1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QKU1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QKU1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms