Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL2C9JE40 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms