Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KNCNA6PVL3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms