Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRRM3A6NNA2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms