Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L3A6NEY3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L3A6NEY3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L3A6NEY3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L3A6NEY3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms