Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6CA6NDK9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6CA6NDK9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms