Protein–RNA interactions for Protein: A6NC62

RBAKDN, Putative RBAK downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAKDNA6NC62 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBAKDNA6NC62 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms