Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf170A2RU37 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf170A2RU37 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms