Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRGMA1A4Y4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms