Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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