Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A0D9SFI3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms