Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARFGEF1Q9Y6D6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGEF1Q9Y6D6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms