Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX10Q9Y5X0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX10Q9Y5X0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms