Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4BQ9Y4P1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4BQ9Y4P1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4BQ9Y4P1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4BQ9Y4P1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4BQ9Y4P1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG4BQ9Y4P1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG4BQ9Y4P1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms