Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SH3BP1Q9Y3L3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP1Q9Y3L3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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