Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG3Q9Y2Y8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG3Q9Y2Y8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms