Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POMPQ9Y244 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POMPQ9Y244 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms